Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atg4cQ811C2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Atg4cQ811C2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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