Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmem39bQ810L4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmem39bQ810L4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms