Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ChfrQ810L3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
ChfrQ810L3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms