Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cracr2bQ80ZJ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cracr2bQ80ZJ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms