Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y55

Bsdc1, BSD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bsdc1Q80Y55 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bsdc1Q80Y55 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bsdc1Q80Y55 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Bsdc1Q80Y55 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bsdc1Q80Y55 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bsdc1Q80Y55 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms