Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc28Q80XJ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc28Q80XJ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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