Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco5bQ80X59 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmco5bQ80X59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms