Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcsk9Q80W65 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Pcsk9Q80W65 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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Pcsk9Q80W65 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcsk9Q80W65 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
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Pcsk9Q80W65 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms