Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Thnsl2Q80W22 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Thnsl2Q80W22 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms