Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
AknaQ80VW7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
AknaQ80VW7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AknaQ80VW7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AknaQ80VW7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
AknaQ80VW7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
AknaQ80VW7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
AknaQ80VW7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
AknaQ80VW7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms