Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Aldh3b1Q80VQ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Aldh3b1Q80VQ0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms