Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc155Q80VJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc155Q80VJ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms