Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube3cQ80U95 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ube3cQ80U95 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube3cQ80U95 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms