Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Klhl29Q80T74 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Klhl29Q80T74 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms