Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo1Q7TT28 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo1Q7TT28 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms