Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Atf7ipQ7TT18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atf7ipQ7TT18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atf7ipQ7TT18 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms