Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Clec18aQ7TSQ1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Clec18aQ7TSQ1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms