Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ppp6r1Q7TSI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp6r1Q7TSI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms