Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Kcnf1Q7TSH7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnf1Q7TSH7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnf1Q7TSH7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms