Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccp110Q7TSH4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccp110Q7TSH4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccp110Q7TSH4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms