Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctdp1Q7TSG2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctdp1Q7TSG2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctdp1Q7TSG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms