Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ9

Arrdc3, Arrestin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc3Q7TPQ9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arrdc3Q7TPQ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arrdc3Q7TPQ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arrdc3Q7TPQ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.1 ms