Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ShprhQ7TPQ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ShprhQ7TPQ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ShprhQ7TPQ3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms