Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Prrc2bQ7TPM1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Prrc2bQ7TPM1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Prrc2bQ7TPM1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Prrc2bQ7TPM1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms