Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nphp3Q7TNH6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nphp3Q7TNH6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms