Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sbno2Q7TNB8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sbno2Q7TNB8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms