Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HhipQ7TN16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HhipQ7TN16 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms