Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ppp1r3cQ7TMB3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp1r3cQ7TMB3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms