Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl2Q78Y63 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl2Q78Y63 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdcl2Q78Y63 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pdcl2Q78Y63 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pdcl2Q78Y63 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pdcl2Q78Y63 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms