Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GypcQ78HU7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GypcQ78HU7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GypcQ78HU7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms