Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rph3alQ768S4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rph3alQ768S4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rph3alQ768S4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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