Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nme8Q715T0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nme8Q715T0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms