Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ncapd3Q6ZQK0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ncapd3Q6ZQK0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms