Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nemp1Q6ZQE4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms