Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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NinlQ6ZQ12 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
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NinlQ6ZQ12 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
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NinlQ6ZQ12 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NinlQ6ZQ12 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NinlQ6ZQ12 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
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