Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

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Length 800 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Chsy1Q6ZQ11 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Chsy1Q6ZQ11 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Chsy1Q6ZQ11 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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