Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smg5Q6ZPY2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Smg5Q6ZPY2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms