Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU8

Casc1, Protein CASC1, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc1Q6TDU8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Casc1Q6TDU8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Casc1Q6TDU8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Casc1Q6TDU8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms