Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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Tcaf3Q6QR59 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcaf3Q6QR59 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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Tcaf3Q6QR59 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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Tcaf3Q6QR59 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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Tcaf3Q6QR59 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tcaf3Q6QR59 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tcaf3Q6QR59 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcaf3Q6QR59 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms