Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q473

Clca4a, Calcium-activated chloride channel regulator 4A, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4aQ6Q473 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clca4aQ6Q473 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clca4aQ6Q473 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clca4aQ6Q473 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms