Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx13Q6PHS6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx13Q6PHS6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms