Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGL7

Washc2, WASH complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc2Q6PGL7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Washc2Q6PGL7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Washc2Q6PGL7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Washc2Q6PGL7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms