Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFQ7

Rasa4, Ras GTPase-activating protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa4Q6PFQ7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasa4Q6PFQ7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasa4Q6PFQ7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasa4Q6PFQ7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasa4Q6PFQ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasa4Q6PFQ7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasa4Q6PFQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasa4Q6PFQ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms