Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CtifQ6PEE2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CtifQ6PEE2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CtifQ6PEE2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms