Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dtx4Q6PDK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dtx4Q6PDK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.3 ms