Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Herc4Q6PAV2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Herc4Q6PAV2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms