Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prkab2Q6PAM0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prkab2Q6PAM0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prkab2Q6PAM0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prkab2Q6PAM0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms