Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fhod1Q6P9Q4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fhod1Q6P9Q4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms