Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4S6

Sik3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik3Q6P4S6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sik3Q6P4S6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sik3Q6P4S6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sik3Q6P4S6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms