Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Paxip1Q6NZQ4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Paxip1Q6NZQ4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms